MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010379	CCT	2	6	16	21	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010379	A	6	6	70	75	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010379	ATTG	2	8	189	196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010379	TTTA	2	8	212	219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010379	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010379	CTA	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010379	T	6	6	336	341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010379	TTA	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010379	TA	3	6	362	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010379	TAAT	2	8	401	408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010379	T	6	6	456	461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010379	T	7	7	546	552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010379	TAA	2	6	568	573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010379	A	7	7	572	578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010379	TA	3	6	656	661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010379	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010379	TTTA	2	8	702	709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010379	A	6	6	880	885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010379	TCT	2	6	1041	1046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010379	T	6	6	1056	1061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010379	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010379	CT	3	6	1305	1310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010379	TCA	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010379	TAAT	2	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010379	T	6	6	1359	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010379	ATA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010379	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010379	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010379	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010379	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010379	ATA	2	6	1489	1494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010379	TA	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010379	TAT	2	6	1518	1523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010379	TA	3	6	1527	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010379	ATGT	2	8	1564	1571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010379	T	7	7	1571	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010379	TAA	3	9	1585	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010379	TA	3	6	1597	1602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010379	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010379	AT	3	6	2131	2136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010379	TA	3	6	2146	2151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010379	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010379	ATT	3	9	3103	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010379	A	8	8	3139	3146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010379	TTTA	2	8	3155	3162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010379	TAAA	2	8	3171	3178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010379	TTA	2	6	3184	3189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010379	TA	4	8	3672	3679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010379	CTA	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010379	ACA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010379	TAT	2	6	4988	4993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010379	ATT	2	6	4995	5000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010379	TCC	2	6	5079	5084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010379	AGA	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010379	TGAA	2	8	5121	5128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010379	CTAT	2	8	6189	6196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010379	AT	3	6	6195	6200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010379	T	6	6	6211	6216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010379	TA	3	6	7046	7051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010379	ATT	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010379	AGG	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010379	A	6	6	7602	7607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010379	T	7	7	7635	7641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010379	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010379	TA	4	8	7650	7657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010379	ATT	2	6	8289	8294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010379	ACT	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010379	TCTA	2	8	8318	8325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010379	GT	3	6	8342	8347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010379	TATAA	2	10	8354	8363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010379	TCC	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010379	AT	3	6	9874	9879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010379	ATT	3	9	9892	9900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010379	CTTT	2	8	10311	10318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010379	ATT	2	6	10328	10333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010379	AAT	2	6	11338	11343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010379	CTC	2	6	11910	11915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_010379	CTT	2	6	11949	11954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010379	ATT	3	9	11959	11967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010379	A	7	7	11975	11981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010379	TA	4	8	12010	12017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010379	T	6	6	12019	12024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010379	TCC	2	6	12651	12656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010379	ATT	2	6	12676	12681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010379	ACTA	2	8	12682	12689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010379	AAT	2	6	12690	12695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010379	TAT	2	6	12696	12701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010379	T	7	7	12711	12717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010379	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010379	CAA	2	6	12744	12749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010379	A	6	6	12748	12753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010379	ATC	2	6	12801	12806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010379	CTTT	2	8	13393	13400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010379	TTAA	2	8	13418	13425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010379	TCC	2	6	13468	13473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010379	TTAT	2	8	13479	13486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010379	A	6	6	13495	13500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010379	CTT	2	6	13705	13710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010379	ACT	2	6	13755	13760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010379	ATT	2	6	13775	13780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010379	TCC	2	6	14076	14081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010379	TAA	2	6	14090	14095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010379	ATT	2	6	14117	14122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010379	ATA	2	6	14681	14686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010379	TAA	2	6	14728	14733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010379	T	6	6	14752	14757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010379	T	8	8	14805	14812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010379	TTAA	2	8	14828	14835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010379	TCC	2	6	15095	15100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010379	TTAAA	2	10	15101	15110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010379	TAA	2	6	15115	15120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010379	ATT	2	6	15526	15531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010379	TTC	2	6	15932	15937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010379	TATT	2	8	15944	15951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010379	TAAT	2	8	15982	15989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010379	TAT	2	6	15990	15995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010379	A	7	7	16004	16010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010379	TCC	2	6	16322	16327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010379	TTA	2	6	16354	16359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010379	ATTA	2	8	16364	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010379	TTA	3	9	16369	16377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010379	A	6	6	16383	16388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010379	TAT	2	6	16391	16396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010379	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010379	AT	3	6	16436	16441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010379	AAGA	2	8	16499	16506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010379	AT	3	6	16714	16719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010379	ATT	2	6	16721	16726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010379	A	6	6	17801	17806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010379	AT	3	6	17816	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010379	ACA	2	6	17842	17847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010379	TAAT	2	8	17863	17870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010379	TAT	2	6	17886	17891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010379	TA	4	8	17929	17936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010379	AATTAA	2	12	17948	17959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010379	ATTTA	2	10	17977	17986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010379	TCCA	2	8	17987	17994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_010379	TA	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010379	T	7	7	19652	19658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010379	TTC	2	6	19706	19711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010379	TTTTA	2	10	21187	21196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010379	ATAA	2	8	21223	21230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010379	A	7	7	21229	21235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010379	TA	3	6	21279	21284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010379	A	6	6	21295	21300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010379	TA	4	8	21347	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010379	AAATTA	2	12	21365	21376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010379	ATTT	2	8	21380	21387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010379	TTTAAT	2	12	21396	21407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010379	TA	3	6	22072	22077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010379	TCC	2	6	22080	22085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_010379	CCT	2	6	22328	22333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_010379	TCA	2	6	22341	22346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010379	T	6	6	22368	22373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010379	TAAA	2	8	22408	22415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010379	TAA	2	6	22445	22450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010379	A	6	6	22531	22536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010379	TA	3	6	22548	22553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_010379	TAT	2	6	22606	22611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_010379	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010379	T	6	6	22792	22797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_010379	TCAT	2	8	38252	38259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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298	NC_010379	CT	3	6	40655	40660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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